Tras trabajar en el CNRS en 1986 y después en la Universidad de Lyon, Christian Mauduit se incorporó en 1993 al Laboratorio de Matemáticas Discretas, creado poco antes por Gérard Rauzy en Luminy. Especialista en teoría de números, se interesó especialmente por la equidistribución en sucesiones como la de Prouhet–Thue–Morse. Se denomina así toda sucesión definida por u0 = 0, u2n = un y u2n+1 = 1 – un. Tales objetos encuentran aplicaciones en matemáticas… y en ajedrez.
Christian Mauduit demostró junto con Joël Rivat que, por término medio, hay tantos números primos cuya suma de cifras decimales es par como números primos para los que es impar (era una conjetura de Gelfond). De hecho, era experto en la complejidad de las sucesiones de números enteros y en la representación de los números enteros en distintas bases. Trabajaba a menudo en colaboración, en particular con los matemáticos húngaros Pál Erdős y András Sárközy.
Además, Christian Mauduit se implicó enormemente para hacer accesibles las matemáticas al mayor número de personas posible. Implantó en la universidad un curso MATh.en.JEANS, organizó cursos de varios días bajo el nombre de Hippocampe, dirigió el IREM de Aix-Marseille de 2006 a 2011 y creó y presidió la asociación Maths pour tous, que organiza numerosas actividades científicas.
