On peut raisonnablement commencer à parler de « méthode scientifique » avec le programme des présocratiques, attribué à Thales de Milet au VI e siècle avant notre ère.
On peut résumer ce programme en trois points :
1) Il faut développer l’art de se poser des questions (proposition qui n’est pas si anodine que cela) ;
2) Il faut essayer d’y répondre sans recourir au mythe ;
3) Une fois le consensus obtenu autour d’un certain nombre de réponses, il est nécessaire de chercher des liens, voire des origines communes, à ces réponses.